Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFKFB4Q16877 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFKFB4Q16877 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PFKFB4Q16877 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFKFB4Q16877 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms