Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms