Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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HIST3H3Q16695 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HIST3H3Q16695 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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