Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKN3Q16667 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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