Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NRF1Q16656 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms