Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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