Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
EFNB3Q15768 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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