Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SS18Q15532 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms