Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CYTH1Q15438 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYTH1Q15438 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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