Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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RAB35Q15286 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RAB35Q15286 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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