Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC3Q15034 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC3Q15034 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HERC3Q15034 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC3Q15034 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC3Q15034 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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