Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
LAPTM4AQ15012 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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LAPTM4AQ15012 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LAPTM4AQ15012 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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