Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFIXQ14938 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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