Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GBX1Q14549 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms