Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
EBI3Q14213 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms