Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CBFBQ13951 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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CBFBQ13951 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CBFBQ13951 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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