Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTCH1Q13635 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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