Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMAD4Q13485 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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