Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTPRJQ12913 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTPRJQ12913 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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