Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCAPQ12770 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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