Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNG1Q06432 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms