Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPCQ03188 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms