Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DSC2Q02487 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms