Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APBA1Q02410 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms