Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP2B2Q01814 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP2B2Q01814 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms