Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HOXC5Q00444 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms