Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HTRA4P83105 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms