Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PPP1CAP62136 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPP1CAP62136 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PPP1CAP62136 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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