Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
KRTAP12-1P59990 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms