Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB15P59190 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB15P59190 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 438.6 ms