Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LOXL3P58215 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LOXL3P58215 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms