Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA8P53708 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 338.2 ms