Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AP3M2P53677 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms