Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIMK1P53667 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIMK1P53667 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LIMK1P53667 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms