Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HK3P52790 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HK3P52790 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HK3P52790 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HK3P52790 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms