Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF143P52747 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms