Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GSK3BP49841 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms