Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCTRP47872 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCTRP47872 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCTRP47872 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCTRP47872 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms