Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms