Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZEB1P37275 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms