Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GJB2P29033 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms