Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms