Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PSMB9P28065 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PSMB9P28065 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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