Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTGS1P23219 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms