Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VCLP18206 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VCLP18206 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms