Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMD1P17707 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMD1P17707 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMD1P17707 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMD1P17707 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMD1P17707 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMD1P17707 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMD1P17707 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMD1P17707 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms