Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYN1P17600 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYN1P17600 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms