Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GATA1P15976 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GATA1P15976 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GATA1P15976 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GATA1P15976 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
GATA1P15976 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
GATA1P15976 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms