Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SFTPCP11686 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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