Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTMAP06454 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTMAP06454 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms